Indonesia memulai langkah dari fase awal karena peringkat yang rendah. Ketika kualifikasi dimulai, Indonesia berada di peringkat 150 FIFA dan posisi 28 di Asia.
Karena berada di luar 26 besar di Asia, tim asuhan Shin Tae Yong harus memulai dari babak pertama. Setelah undian, Indonesia dipastikan melawan Brunei Darussalam.
Pada pertandingan yang berlangsung Oktober 2023, Indonesia menang telak 6-0 di kandang dan 6-0 di tandang. Skor agregat 12-0 menjadi kemenangan terbesar di babak pertama Kualifikasi Piala Dunia 2026 zona Asia.
Di babak kedua, Indonesia tergabung di Grup F bersama Irak, Vietnam, dan Filipina.
Setelah kekalahan 1-5 dari Irak di laga pembuka, Indonesia mulai mengumpulkan poin dengan hasil imbang melawan Filipina dan kemenangan atas Vietnam dalam dua pertandingan berbeda.
Meskipun kembali kalah dari Irak, Indonesia berhasil menaklukkan Filipina. Tiga poin dari kemenangan melawan The Azkals memastikan Indonesia sebagai runner-up Grup F, melaju ke babak ketiga Kualifikasi Piala Dunia 2026 dan mendapatkan tiket ke Piala Asia 2027.
Selain Indonesia, ada sembilan negara lain yang lolos dari babak pertama ke babak kedua, namun mereka tidak mampu melaju lebih jauh.
Hong Kong, Taiwan, Yaman, Afghanistan, Singapura, Myanmar, Nepal, Bangladesh, dan Pakistan semuanya terhenti di babak kedua.
Setelah kemenangan besar atas Brunei di babak pertama dan perjuangan keras melawan Irak, Vietnam, serta Filipina di babak kedua, Indonesia akan menghadapi lawan yang lebih berat di babak ketiga.
